MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 47331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013198	GTG	2	6	184	189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258506996
2	NC_013198	TCA	2	6	230	235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258506996
3	NC_013198	GCATCA	2	12	267	278	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	258506996
4	NC_013198	CGATGA	2	12	285	296	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	258506996
5	NC_013198	CAA	2	6	301	306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258506996
6	NC_013198	CGG	2	6	392	397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258506996
7	NC_013198	TTTA	2	8	442	449	25 %	75 %	0 %	0 %	258506996
8	NC_013198	CGG	2	6	450	455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258506996
9	NC_013198	AAT	2	6	511	516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258506996
10	NC_013198	TCCA	2	8	574	581	25 %	25 %	0 %	50 %	258506996
11	NC_013198	GTTG	2	8	633	640	0 %	50 %	50 %	0 %	258506996
12	NC_013198	TTC	2	6	652	657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258506996
13	NC_013198	AAG	2	6	665	670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258506996
14	NC_013198	AAG	2	6	677	682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258506996
15	NC_013198	TTC	2	6	685	690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258506996
16	NC_013198	CCG	2	6	823	828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258506996
17	NC_013198	AGA	2	6	873	878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258506996
18	NC_013198	GAA	2	6	984	989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258506996
19	NC_013198	GAT	2	6	1042	1047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258506996
20	NC_013198	A	6	6	1265	1270	100 %	0 %	0 %	0 %	258506996
21	NC_013198	ACC	2	6	1285	1290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258506996
22	NC_013198	ATG	2	6	1567	1572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258506997
23	NC_013198	GCT	2	6	1698	1703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258506997
24	NC_013198	GCA	2	6	1729	1734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258506997
25	NC_013198	GC	3	6	1755	1760	0 %	0 %	50 %	50 %	258506997
26	NC_013198	TTC	2	6	1761	1766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258506997
27	NC_013198	CGTTGC	2	12	2042	2053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258506997
28	NC_013198	CAG	2	6	2095	2100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258506997
29	NC_013198	CAT	3	9	2120	2128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258506997
30	NC_013198	TAT	2	6	2212	2217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258506997
31	NC_013198	CTG	2	6	2331	2336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258506997
32	NC_013198	AGC	2	6	2373	2378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258506997
33	NC_013198	GTG	2	6	2385	2390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258506997
34	NC_013198	GAA	2	6	2460	2465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258506997
35	NC_013198	CGA	3	9	3149	3157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258506998
36	NC_013198	CAC	2	6	3174	3179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258506998
37	NC_013198	TGAT	2	8	3221	3228	25 %	50 %	25 %	0 %	258506998
38	NC_013198	GCG	2	6	3230	3235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258506998
39	NC_013198	CGT	2	6	3295	3300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258506998
40	NC_013198	A	6	6	3389	3394	100 %	0 %	0 %	0 %	258506999
41	NC_013198	GCAAG	2	10	3464	3473	40 %	0 %	40 %	20 %	258506999
42	NC_013198	GC	3	6	3510	3515	0 %	0 %	50 %	50 %	258506999
43	NC_013198	CAA	2	6	3527	3532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258506999
44	NC_013198	GC	3	6	3567	3572	0 %	0 %	50 %	50 %	258506999
45	NC_013198	AATT	2	8	3616	3623	50 %	50 %	0 %	0 %	258506999
46	NC_013198	TCA	2	6	3629	3634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258506999
47	NC_013198	GATCG	2	10	3654	3663	20 %	20 %	40 %	20 %	258506999
48	NC_013198	TTTG	2	8	3707	3714	0 %	75 %	25 %	0 %	258506999
49	NC_013198	GCG	2	6	3755	3760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258506999
50	NC_013198	GGC	2	6	3920	3925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258506999
51	NC_013198	TGC	2	6	3961	3966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258506999
52	NC_013198	CAA	2	6	3996	4001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258506999
53	NC_013198	TGC	2	6	4052	4057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258506999
54	NC_013198	AGC	2	6	4114	4119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258506999
55	NC_013198	GAT	2	6	4167	4172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258506999
56	NC_013198	CAG	2	6	4224	4229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258506999
57	NC_013198	CAC	2	6	4232	4237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258506999
58	NC_013198	AGTTA	2	10	4247	4256	40 %	40 %	20 %	0 %	258506999
59	NC_013198	GAT	2	6	4311	4316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258506999
60	NC_013198	ATC	2	6	4425	4430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258506999
61	NC_013198	AAGA	2	8	4525	4532	75 %	0 %	25 %	0 %	258507000
62	NC_013198	GAA	2	6	4540	4545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507000
63	NC_013198	AAGA	2	8	4546	4553	75 %	0 %	25 %	0 %	258507000
64	NC_013198	GCA	2	6	4561	4566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507000
65	NC_013198	ATG	2	6	4571	4576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507000
66	NC_013198	CAT	2	6	4663	4668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507000
67	NC_013198	TTGAAG	2	12	4730	4741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507000
68	NC_013198	GAT	2	6	4771	4776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507000
69	NC_013198	GTC	2	6	4814	4819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507000
70	NC_013198	GGT	2	6	4855	4860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507000
71	NC_013198	TGGCGG	2	12	4866	4877	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	258507000
72	NC_013198	CGG	2	6	4890	4895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507000
73	NC_013198	GTT	2	6	4954	4959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507000
74	NC_013198	CGG	2	6	4962	4967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507000
75	NC_013198	GAGCAT	2	12	5038	5049	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	258507000
76	NC_013198	CCGGAT	2	12	5071	5082	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258507000
77	NC_013198	TGA	2	6	5106	5111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507000
78	NC_013198	GCG	2	6	5188	5193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507000
79	NC_013198	GGC	2	6	5224	5229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507000
80	NC_013198	GAA	3	9	5256	5264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507000
81	NC_013198	CTG	2	6	5272	5277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507000
82	NC_013198	GGC	2	6	5398	5403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507000
83	NC_013198	GAT	2	6	5485	5490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507000
84	NC_013198	GTT	2	6	5530	5535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507000
85	NC_013198	AGACCA	2	12	5570	5581	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	258507000
86	NC_013198	GGT	2	6	5607	5612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507000
87	NC_013198	ATT	2	6	5677	5682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507000
88	NC_013198	GCT	2	6	5716	5721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507000
89	NC_013198	AAG	2	6	5746	5751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507000
90	NC_013198	ACA	2	6	5792	5797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507000
91	NC_013198	GAA	2	6	5959	5964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507000
92	NC_013198	ATC	2	6	6043	6048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507000
93	NC_013198	CCGATG	2	12	6053	6064	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258507000
94	NC_013198	GTT	2	6	6087	6092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507000
95	NC_013198	GCC	2	6	6156	6161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507000
96	NC_013198	ATG	2	6	6187	6192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507000
97	NC_013198	GCC	2	6	6240	6245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507000
98	NC_013198	GCCA	2	8	6295	6302	25 %	0 %	25 %	50 %	258507000
99	NC_013198	ACC	2	6	6313	6318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507000
100	NC_013198	CGG	2	6	6418	6423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507000
101	NC_013198	GAA	2	6	6433	6438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507000
102	NC_013198	TTG	2	6	6449	6454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507000
103	NC_013198	AAC	2	6	6460	6465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507000
104	NC_013198	GAT	2	6	6543	6548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507001
105	NC_013198	ACGT	2	8	6649	6656	25 %	25 %	25 %	25 %	258507001
106	NC_013198	ATGA	2	8	6696	6703	50 %	25 %	25 %	0 %	258507001
107	NC_013198	AAG	2	6	6732	6737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507001
108	NC_013198	TCG	2	6	6748	6753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507001
109	NC_013198	TGACGG	2	12	6878	6889	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258507001
110	NC_013198	GCG	3	9	6891	6899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507001
111	NC_013198	CAA	2	6	6956	6961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507001
112	NC_013198	GATT	2	8	6968	6975	25 %	50 %	25 %	0 %	258507001
113	NC_013198	GTT	2	6	7011	7016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507001
114	NC_013198	GC	3	6	7023	7028	0 %	0 %	50 %	50 %	258507001
115	NC_013198	CTG	2	6	7038	7043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507001
116	NC_013198	ACC	2	6	7077	7082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507001
117	NC_013198	CCG	2	6	7089	7094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507001
118	NC_013198	ATC	2	6	7138	7143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507001
119	NC_013198	CCA	2	6	7150	7155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507001
120	NC_013198	TTA	2	6	7318	7323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507001
121	NC_013198	TGG	2	6	7357	7362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507001
122	NC_013198	GAAAA	2	10	7386	7395	80 %	0 %	20 %	0 %	258507001
123	NC_013198	TGA	2	6	7418	7423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507001
124	NC_013198	CCG	2	6	7460	7465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507001
125	NC_013198	AAT	2	6	7491	7496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507001
126	NC_013198	TGG	2	6	7540	7545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507001
127	NC_013198	CGG	3	9	7626	7634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507001
128	NC_013198	GAA	2	6	7649	7654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507001
129	NC_013198	ATT	2	6	7725	7730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507001
130	NC_013198	ATT	2	6	7938	7943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507001
131	NC_013198	ATG	2	6	7945	7950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507001
132	NC_013198	CTG	2	6	7998	8003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507001
133	NC_013198	TGAAGA	2	12	8024	8035	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	258507001
134	NC_013198	AAG	2	6	8047	8052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507001
135	NC_013198	GGT	2	6	8127	8132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507001
136	NC_013198	GAT	2	6	8163	8168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507001
137	NC_013198	TCG	2	6	8170	8175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507001
138	NC_013198	ATG	2	6	8200	8205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507001
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140	NC_013198	CAA	2	6	8222	8227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507001
141	NC_013198	GCA	2	6	8242	8247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507001
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144	NC_013198	GCA	2	6	8443	8448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507001
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146	NC_013198	CGG	2	6	8741	8746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507001
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148	NC_013198	TGA	2	6	8833	8838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507001
149	NC_013198	CCGG	2	8	8887	8894	0 %	0 %	50 %	50 %	258507001
150	NC_013198	CGA	2	6	8924	8929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507001
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152	NC_013198	CAG	2	6	8987	8992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507001
153	NC_013198	TGA	2	6	9131	9136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507001
154	NC_013198	CTG	3	9	9428	9436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507002
155	NC_013198	ATG	2	6	9845	9850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507003
156	NC_013198	TGG	2	6	9907	9912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507003
157	NC_013198	CGAA	2	8	9930	9937	50 %	0 %	25 %	25 %	258507003
158	NC_013198	TAA	2	6	9940	9945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507003
159	NC_013198	TTG	2	6	9963	9968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507003
160	NC_013198	TGG	2	6	9979	9984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507003
161	NC_013198	GGT	2	6	10028	10033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507003
162	NC_013198	TGG	2	6	10067	10072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507003
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165	NC_013198	ATA	2	6	10588	10593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258507004
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242	NC_013198	TGTT	2	8	15857	15864	0 %	75 %	25 %	0 %	258507012
243	NC_013198	GCC	2	6	15876	15881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507012
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247	NC_013198	A	6	6	16051	16056	100 %	0 %	0 %	0 %	258507012
248	NC_013198	TGC	2	6	16136	16141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507012
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251	NC_013198	TTTA	2	8	16291	16298	25 %	75 %	0 %	0 %	258507012
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255	NC_013198	GAA	2	6	16551	16556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507013
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257	NC_013198	GTT	2	6	16681	16686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507013
258	NC_013198	GAC	2	6	16727	16732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507013
259	NC_013198	TTG	2	6	16867	16872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507014
260	NC_013198	GAC	2	6	16885	16890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507014
261	NC_013198	CAG	2	6	16912	16917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507014
262	NC_013198	GGT	2	6	16975	16980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507014
263	NC_013198	GAA	2	6	16993	16998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507014
264	NC_013198	GTTT	2	8	17002	17009	0 %	75 %	25 %	0 %	258507014
265	NC_013198	CAA	2	6	17271	17276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507015
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267	NC_013198	CTCGA	2	10	17409	17418	20 %	20 %	20 %	40 %	258507015
268	NC_013198	TTC	2	6	17523	17528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507015
269	NC_013198	CG	3	6	17560	17565	0 %	0 %	50 %	50 %	258507015
270	NC_013198	GCT	2	6	17657	17662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507015
271	NC_013198	ACA	2	6	17671	17676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507015
272	NC_013198	AAG	2	6	17688	17693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507015
273	NC_013198	CGC	2	6	17700	17705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507015
274	NC_013198	AAG	2	6	17742	17747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507015
275	NC_013198	TGA	2	6	17846	17851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507015
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279	NC_013198	TTC	2	6	18117	18122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258507015
280	NC_013198	TAC	2	6	18231	18236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507015
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283	NC_013198	TTG	2	6	19344	19349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507016
284	NC_013198	T	7	7	19366	19372	0 %	100 %	0 %	0 %	258507016
285	NC_013198	GTA	2	6	19398	19403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507016
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287	NC_013198	GTA	2	6	19446	19451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507016
288	NC_013198	AT	4	8	19452	19459	50 %	50 %	0 %	0 %	258507016
289	NC_013198	A	6	6	19492	19497	100 %	0 %	0 %	0 %	258507016
290	NC_013198	GA	3	6	19517	19522	50 %	0 %	50 %	0 %	258507016
291	NC_013198	T	6	6	19525	19530	0 %	100 %	0 %	0 %	258507016
292	NC_013198	TGG	2	6	19538	19543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507016
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294	NC_013198	ATC	2	6	19637	19642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258507016
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297	NC_013198	T	6	6	19770	19775	0 %	100 %	0 %	0 %	258507016
298	NC_013198	TGG	2	6	19814	19819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258507016
299	NC_013198	ATT	2	6	19827	19832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507016
300	NC_013198	GTT	2	6	19848	19853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507016
301	NC_013198	TTG	2	6	19933	19938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258507016
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376	NC_013198	CAAAC	2	10	25027	25036	60 %	0 %	0 %	40 %	258507021
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378	NC_013198	GATTT	2	10	25232	25241	20 %	60 %	20 %	0 %	258507021
379	NC_013198	CAA	2	6	25271	25276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258507021
380	NC_013198	ATT	2	6	25286	25291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507021
381	NC_013198	TTA	2	6	25305	25310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258507021
382	NC_013198	AC	3	6	25331	25336	50 %	0 %	0 %	50 %	258507021
383	NC_013198	GATG	2	8	25422	25429	25 %	25 %	50 %	0 %	258507021
384	NC_013198	AGC	2	6	25433	25438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507021
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386	NC_013198	GAC	2	6	25808	25813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258507022
387	NC_013198	TAAA	2	8	25879	25886	75 %	25 %	0 %	0 %	258507022
388	NC_013198	AAG	2	6	25994	25999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258507023
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391	NC_013198	CGT	2	6	26059	26064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258507023
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494	NC_013198	CCG	2	6	32508	32513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258507027
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496	NC_013198	GCG	2	6	32667	32672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258507027
497	NC_013198	CAC	2	6	32696	32701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258507027
498	NC_013198	GAT	2	6	32702	32707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258507027
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